В последние годы отмечено неудовлетворительное состояние деревьев, высаженных вдоль границ Ботанического сада Ботанического института им. В.Л. Комарова РАН. Для установления причины угнетения деревьев были проведены исследования с использование физиономических и биогеохимических методов. Визуальные признаки состояния деревьев дали худшие показатели для деревьев, растущих по периферии сада. Также вблизи проезжей части наблюдаются повышенные концентрации ионов Na⁺ и Cl^– в почвах и в корке деревьев, причем в корке липы они в 2–4 раза превышают фоновые. Загрязнение почв тяжелыми металлами выявлено в восточной части сада, где отмечены высокие концентрации Mn, Zn, Pb и Cd. Содержание тяжелых металлов в листьях деревьев незначительно превышает фоновые значения. Содержание тяжелых металлов в корке деревьев существенно превышает фоновые значения по всем исследованным элементам, кроме Mn и Co. Основными элементами-загрязнителями выступают Pb, Cu, Ni. Высокие значения суммарного показателя загрязнения корки деревьев отмечены как на периферии сада, так и в его центре, что говорит о невозможности дифференцировать территорию сада по уровню загрязнения тяжелыми металлами. Загрязнение среды солями у окраин сада проявляется сильнее, оказывая стрессовое воздействия на древесную растительность, однако в каждом конкретном случае угнетение деревьев может быть усилено воздействием дополнительных причин (подтопление, заболевания и др.).